El profesor Vargas-Alzate cuenta con un doctorado en Estudios Políticos con énfasis en Relaciones Internacionales de la Universidad Externado de Colombia, una maestría en Estudios Políticos con énfasis en Relaciones Internacionales, de la Universidad Pontificia Bolivariana, una especialización en Estudios Políticos con énfasis en Geopolítica, de la Universidad EAFIT, y un pregrado en Historia de la Universidad Nacional de Colombia, obtenido en 1998.
El profesor Vargas-Alzate ha sido directivo de la Red Colombiana de Relaciones Internacionales desde su fundación en 2009, ocupando diferentes cargos en la Junta Directiva, entre los que se destacan la presidencia, vicepresidencia y, actualmente, la tesorería de la Corporación. Es analista internacional en medios de comunicación y columnista regular del periódico La República. Sus áreas de interés académico e investigativos se relacionan con la política exterior, la política internacional y las relaciones internacionales de Colombia. Así mismo, trabaja en temas de política exterior latinoamericana e integración regional. En la Universidad EAFIT ha ocupado cargos directivos, administrativos y académicos.